Quando il documento viene salvato, tutte le informazioni sul progetto vengono conservate, consentendo di modificarlo in un secondo momento. La pubblicazione viene salvata come file singolo con l’estensione .afpub.
La prima volta che si salva il documento, verrà chiesto di assegnare un nome al progetto e di salvare la posizione. In seguito, i salvataggi successivi sovrascriveranno la versione precedente.
Facoltativamente, è possibile salvare un progetto corrente come nuovo progetto. In questo caso, il nuovo file non sovrascriverà la versione salvata.
Le modifiche non salvate effettuate su un documento sono contrassegnate da [Modificato] a destra del nome del documento, nella parte superiore della sua scheda/finestra.
Le modifiche non salvate effettuate su un documento sono indicate da sono contrassegnate da [Modificato] o [M] a destra del nome del documento, nella parte superiore della sua scheda/finestra, e da una stella a destra del nome del documento corrente, nella parte superiore della finestra di Affinity Publisher.