Непрозрачность слоя определяет степень просвечиваемости активного слоя и перекрытия или отображения нижележащего слоя. При значении непрозрачности 1 % слой почти прозрачен, тогда как при значении 100 % непрозрачность слоя абсолютна.
Для быстрой установки непрозрачности выделенных слоев можно использовать клавиши с цифрами.